登瀛書院位於草屯鎮新庄里史館路文昌巷三十號。
建於道光廿七年（1847年），民國七十四年（1985年）十一月廿七日，經內政部公告指定為臺閩地區第三級古蹟(一九九七年四月依法改為縣定古蹟)。清代初期草屯為北投社之地，舊稱北投保。其時漢人向平埔番人得耕土地，並且興修水利，至乾隆年間，草屯地方已形成了洪、李、林、簡四大姓之血緣聚落。其中之洪姓支派，開鑿「茄荖馬助圳」，聚族而居，後來成為倡建書院之登瀛社的主要成員。
南北投設學最早的記錄始於雍正十二年（1734年），分巡臺灣道張嗣昌為推廣教化，建議於南北二路熟番社普設土番社學，因此在南北投保即有南投、北投兩所社學。這兩個社學是以教育歸附土番子弟為目的，其教學不僅施於番童，並兼充普通義塾，漢番混學居多。之後漢人入墾日多，到了道光十一年（1831年），南投縣丞朱承懋延請南北投保、沙連保等士紳籌建書院，作為南、北投保兩地漢人讀書的場所，此即為道光十三年（1833年）建立之南投「藍田書院」。
至道光初年，西部平埔族群，在北投社番引導下陸續遷入埔里盆地，身為入埔要道之北投保，地位益形重要。根據周璽《彰化縣志》之記載，道光初年，北投保文風已開，雖無文昌祠之立，但已有士紳會文結社，以為敬業樂群之所，此即為登瀛社，登瀛書院即是在登瀛社員的推動下而成立。由於藍田書院遠在南投，對於北投保之學子甚感不便，因此，於道光廿七年（1847年）十月，莊文蔚、洪濟純等首倡，向北投保內士紳殷戶，募款得五千八百元，創建登瀛書院。是年十一月興工，道光廿八年（1848年）十二月竣工，以為教學處所，並祀文昌帝君，草屯一帶文風更是大興。然雖為書院，仍不脫「義學」之性質。其經費來源除信徒捐置學田外，曾接受彰化白沙書院的資助，故與白沙書院關係密切，學規、修業有可能依循白沙書院。
光緒九年（1883年），院舍年久失修，由李定邦、林錫爵、簡化成等人首倡，再向北投保內士紳募得二千三百元、加上玉峰社捐資二百元、碧峰社捐資一百元、萃英社捐資五十元，予以重修，於光緒十年（1884年）一月竣工。
日治後，書院功能消失，而以文昌祠存之。
二戰後，經民國五十六年、七十五年、七十七年之重修而成今日之面貌。
目前書院正殿中央供奉文昌帝君，左奉紫陽夫子朱氏、右奉魁斗星君。
登瀛書院的格局是單進三合院式建築，座中為三開間正殿，兩側為七間式廂房，正殿與廂房間有過水相連。書院四週有圍牆圍繞，正面為長十三公尺的三脊燕尾照壁。基地全寬38.5公尺，縱深50公尺。書院正門、門柱皆有題聯，大廳內並存有古匾「學教敬倫」「輔翼聖教」。除此之外，其閩南花紋磚與樑上的結構，別具特色。東西廂壁上之書卷狀雕飾，也是古意盎然。  
民國74年(1985)11月27日正式公告為「國家三級古蹟」。
公告文號：74臺內民字第357272號

外觀特徵：
登瀛書院為單進兩翼齋舍的三合院建築，中央為三開門的正殿，屋頂是燕尾翹脊、雙龍護塔，正前有照牆(照壁)一座，正殿之右前方有惜字亭。遍查台灣六十二所書院中，創建年度有早晚，規模大小有別，財務情形各異而各具有特色，但建築物大部分已失去了原貌。

室內特徵：
登瀛書院為單進兩翼齋舍的三合院建築，中央為三開門的正殿，屋頂是燕尾翹脊、雙龍護塔，正前有照牆(照壁)一座，正殿之右前方有惜字亭。

使用情形：
1.登瀛書院建築物經被評定為書院類建築物之最完整者，一百餘年間，雖曾四次大修，然均能依照原貌加予修繕，不僅正殿之結構體毫未予更動，連兩排齋舍也不增減一間，建材之土墼(土埆)也未更換為磚塊，完整的保持初建原貌，真是一大特色，堪稱為珍貴的文化資產。
2.開放供民眾拜拜祭祀用。

現狀：
民國77年(1988)修復竣工，回復大體原貌，重振地方往昔文風。
民國88年(1999)「921」震災造成登瀛書院嚴重傾斜及塌陷。
民國91年(2002)11月8日修復完竣，依原貌修復現狀保存。
民國110年(2021)2月15日三川正殿彩繪修復完竣，依原貌修復現狀保存。